Evaluación de la redundancia genética con microsatellites y proteínas del endospermo en accesiones de trigo duro

  • M. Ruiz Centro de Recursos Fitogenéticos (CRF). INIA. Alcalá de Henares (Madrid)
  • E. Aguiriano Centro de Recursos Fitogenéticos (CRF). INIA. Alcalá de Henares (Madrid)
  • P. Giraldo ETSI Agrónomos. Universidad Politécnica de Madrid (UPM).
  • J. M. Carrillo ETSI Agrónomos. Universidad Politécnica de Madrid (UPM).
Palabras clave: cereales, collectiones ex-situ, datos moleculares, duplicados, prolaminas

Resumen

Reducir la existencia de duplicados en las colecciones ex-situ es una tarea complicada que require el uso de buenos marcadores geneticos. En el presente trabajo, se evalúa el valor de las proteínas del endospermo y de los SSRs para la identificación de duplicados potenciales y el análisis de la variabilidad dentro de las accesiones. Se han seleccionado 50 accesiones de trigo duro (Triticum turgidum ssp. durum), agrupadas en 23 duplicados potenciales y previamente caracterizadas para 39 caracteres agro-morfológicos. Se ha analizado su composición en proteina total, alelos de gluteninas de alto peso molecular (HMWG) y 24 SSRs, cubriendo gran parte del genoma. Con los datos de los alelos de proteínas y SSRs se han generado matrices de similitud y disimilitud. En las accesiones heterogéneas para gliadinas se ha calculado el porcentaje de homología entre los patrones de gliadinas (PH) y el coeficiente de identidad genética de Nei (I). Los 18 duplicados idénticos en su composición en proteínas mostraron menos de 3 alelos SSRs diferentes. En las accesiones heterogéneas, los valores de PH e I menores de 80 identificaron a los individuos fuera de tipo, con más de 3 alelos SSRs diferentes. Solamente aquellos biotipos que diferían en no más de 1 locus proteíco se confirmaron con SSRs. Se ha detectado una buena concordancia entre los datos de proteínas, los SSRs y los caracteres agromorfológicos. Sin embargo, las discrepancias observadas en algunos casos avalan la necesidad de evaluar la redundancia mediante distintos marcadores. El análisis conjunto de los datos de proteínas y SSRs es muy útil en la identificación de duplicados, biotipos, genotipos cercanos y contaminaciones.

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Citas

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Publicado
2011-03-01
Cómo citar
Ruiz, M., Aguiriano, E., Giraldo, P., & Carrillo, J. M. (2011). Evaluación de la redundancia genética con microsatellites y proteínas del endospermo en accesiones de trigo duro. Spanish Journal of Agricultural Research, 9(1), 156-165. https://doi.org/10.5424/sjar/20110901-160-10
Sección
Mejora vegetal, genética y recursos genéticos