Comunicación corta: SNPs en el gen CSN1S2 de la alfaS2–caseina ovina
Resumen
En este trabajo se describen dieciocho SNPs (9 transiciones y 9 transversiones) encontrados en la secuencia que abarca los exones 7 a 11 del gen CSN1S2 ovino, trece situados en los intrones 7 (5 SNPs), 8 (2 SNPs), 9 (1 SNP) y 10 (5 SNPs), y cinco en los exones 10 (4 SNPs) y 11 (1 SNP). Las frecuencias alélicas de los SNPs se han obtenido a partir de diecisiete animales de la raza Merino. Entre los polimorfismos intrónicos, los dos SNPs adyacentes g. [435C> A; 436T> G] se encuentran situados en la región rica en pirimidinas, cerca del sitio 3' aceptor de procesamiento del intrón 10, lo que podría afectar la maduración de su ARNm. El análisis de las secuencias de aminoácidos deducidas de los exones 10 y 11 muestra que los polimorfismos ex10-153G>T y ex10-155C>T, que afectan al mismo codón, y ex11-504A>G, son sustituciones no sinónimas, responsables de los cambios aminoacídicos Asp75 a Tyr75 e Ile105 a Val105, respectivamente, dando lugar a los alelos A y B previamente identificados por secuenciación directa de la proteína madura. Para estos SNPs sólo se detectaron seis de las ocho posibles combinaciones, siendo GCA el haplotipo más frecuente (0.323), correspondiente a Asp75 - Ile105 en la proteína madura. Los nuevos polimorfismos del gen ovino para la S2-caseína, que se describen en este trabajo, enriquecen el mapa de marcadores moleculares que podrían ser utilizados para investigar su asociación con caracteres de producción.Descargas
Citas
Amigo L, Recio I, Ramos M, 2000. Genetic polymorphism of ovine milk proteins: its influence on technological properties of milk—a review. Int Dairy J 10: 135–149.
Boisnard M, Hue D, Bouniol C, Mercier JC, Gaye P, 1991. Multiple mRNA species code for two non-allelic forms of ovine αS2-casein. Eur J Biochem 201: 633–641.
http://dx.doi.org/10.1111/j.1432-1033.1991.tb16324.x
PMid:1935959
Caroli AM, Chessa S, Erhardt GJ, 2009. Invited review: Milk protein polymorphisms in cattle: Effect on animal breeding and human nutrition. J Dairy Sci 92: 5335-5352.
http://dx.doi.org/10.3168/jds.2009-2461
PMid:19841193
Ceriotti G, Chessa S, Bolla P, Budelli E, Bianchi L, Duranti E, Caroli A, 2004. Single nucleotide polymorphisms in the ovine casein genes detected by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism. J Dairy Sci 87: 2606–2613.
http://dx.doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(04)73386-X
Chessa S, Bolla P, Dario C, Pieragostini E, Caroli A, 2003. Genetic milk protein polymorphisms in the Gentile di Puglia ovine breed: monitoring by isoelectric focusing. Sci Tecn Latt-Cas 54: 191–198.
Ferranti P, Malorni A, Nitti G, Laezza P, Pizzano R, Chianese L, Addeo F, 1995. Primary structure of ovine αS1-caseins: localization of phosphorylation sites and characterization of genetic variants A, C and D. J Dairy Res 62: 281–296.
http://dx.doi.org/10.1017/S0022029900030983
PMid:7601973
Giambra IJ, Erhardt G, 2012. Molecular genetic characterization of ovine CSN1S2 variants C and D reveal further important variability within CSN1S2. Anim Genet 43: 642-645.
http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02299.x
PMid:22497628
Giambra IJ, Jäger S, Erhardt G, 2010. Isoelectric focusing reveals additional casein variants in German sheep breeds. Small Ruminant Res 90: 11-17.
http://dx.doi.org/10.1016/j.smallrumres.2009.12.025
Lenasi T, Peterlin BM, Dovc P, 2006. Distal regulation of alternative splicing by splicing enhancer in equine β-casein intron 1. RNA 12: 498-507.
http://dx.doi.org/10.1261/rna.7261206
PMid:16431989 PMCid:1383587
Martin P, Szymanowska M, ZwIerzchowski L, Leroux C, 2002. The impact of genetic polymorphisms on the protein composition of ruminant milks. Reprod Nutr Dev 42: 433–459.
http://dx.doi.org/10.1051/rnd:2002036
PMid:12537255
Mohr U, Koczan D, Linder D, Hobom G, Erhardt G, 1994. A single point mutation results in A allele-specific exon skipping in the bovine αS1-casein mRNA. Gene 143: 187–192.
http://dx.doi.org/10.1016/0378-1119(94)90095-7
Nilsen H, Olsen HG, Hayes B, Sehested E, Svendsen M, Nome T, Meuwissen T, Lien S, 2009. Casein haplotypes and their association with milk production traits in Norwegian Red cattle. Genet Sel Evol 41: 24.
http://dx.doi.org/10.1186/1297-9686-41-24
PMid:19284706 PMCid:3225817
Picariello G, Rignanese D, Chessa S, Ceriotti G, Trani A, Caroli A, Di Luccia A, 2009. Characterization and genetic study of the ovine _S2-Casein (CSN1S2) Allele B. Protein J 28: 333–340.
http://dx.doi.org/10.1007/s10930-009-9198-8
PMid:19771496
Rijnkels M, 2002. Multispecies comparison of the casein gene loci and evolution of casein gene family. J. Mammary Gland Biol 7: 327-345.
http://dx.doi.org/10.1023/A:1022808918013
© CSIC. Los originales publicados en las ediciones impresa y electrónica de esta Revista son propiedad del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, siendo necesario citar la procedencia en cualquier reproducción parcial o total.
Salvo indicación contraria, todos los contenidos de la edición electrónica se distribuyen bajo una licencia de uso y distribución “Creative Commons Reconocimiento 4.0 Internacional ” (CC BY 4.0). Consulte la versión informativa y el texto legal de la licencia. Esta circunstancia ha de hacerse constar expresamente de esta forma cuando sea necesario.
No se autoriza el depósito en repositorios, páginas web personales o similares de cualquier otra versión distinta a la publicada por el editor.









